В структуру УЗ "ВОСПК" входят: административно-управленческий персонал; отделение комплектования донорских кадров; отделение заготовки крови и ее компонентов; клиническая лаборатория; лаборатория серодиагностики инфекционных заболеваний; лаборатория иммунологических стандартов; отдел препаратов крови; отделение производства препаратов; отдел контроля качества; отдел технического обслуживания; организационно-методический отдел.